Южно-Казахстанская государственная фармацевтическая академия (бывшая ЮКГМА) сегодня является ведущим государственным высшим учебным заведением, осуществляющим подготовку фармацевтических кадров. В настоящее время в ЮКГФА ведется подготовка специалистов с высшим образованием фармацевтического и медицинского профиля в объеме бакалавриата, магистратуры и резидентуры. А также осуществляется обучение в интернатуре. На ФПСсТПО при академии ведется подготовка специалистов со средним профессиональным образованием по специальностям фармации и медицины.

Основной миссией южно-Казахстанской государственной фармацевтической академии является подготовка высококвалифицированных конкурентоспособных специалистов фармацевтического и медицинского профиля для Южного региона и страны в целом на основе достижений современной науки и практики, готовых адаптироваться к быстро изменяющимся условиям в фармацевтической и медицинской отрасли путем непрерывного повышения компетентности и развития творческой инициативы.

ЮКГФА сегодня — это эффективная система фармацевтического и медицинского образования, основанной на компетентностном подходе и потребностях практического здравоохранения и фармацевтической отрасли, ориентированной на подготовку специалистов, соответствующих международным стандартам качества и безопасности.

В целях совершенствования учебного процесса по подготовке специалистов в соответствии с современными требованиями в академии уделяется особое внимание внедрению новых передовых форм и методов обучения.

Данная работа проводится по следующим основным направлениям:
- подготовка и проведение проблемных лекций;
- организация лекций, семинаров, практических занятий с применением демонстрационного материала в форме мультимедийных презентаций, учебных видеофильмов, слайдов, а также обучающих программ, Интернет-ресурсов для поиска необходимой информации;
- использование в учебном процессе ролевых и деловых игр;
- использование для обучения практическим навыкам муляжей, фантомов, метода стандартизированных пациентов в учебном клинико-симуляционном центре и оборудования клинико-диагностической лаборатории;
- тестирование для оценки знаний студентов.

В ЮКГФА созданы условия для внедрения активных методов обучения в учебный процесс. С 2009-2010 учебно-го года по настоящее время (2014-2015 учебный год) в учебный процесс интенсивно внедряются новые формы и методы обучения, средства активизации познавательной деятельности:
- Проблемно-ориентированное обучение (PBL);
- Командно-ориентированное обучение (TBL);
- Обучение, основанное на случае (CBL);
- Обучение, основанное на симуляционных технологиях – интерактивные компьютерные манекены, виртуальные компьютерные программы-симуляторы, стандартизированные пациенты;
- Исследовательские технологии – проектно-ориентированное обучение;

В педагогическом процессе академии для развития познавательной активности студентов широко используются методы проблемного обучения в процессе чтения лекций и проведения практических занятий. Методы проблемного обучения применяются на практических занятиях и семинарах в виде решения проблемных задач, использования деловых игр, адаптированных к конкретным курсам и темам, ролевого тренинга.

В ЮКГФА имеются: учебный клинико-симуляционный центр (УКСЦ), клинико-диагностическая лаборатория (КДЛ ), компьютерно-тестовый и издательский центр (КТИЦ), библиотечно-информационный центр (БИЦ), анатомический музей, спортивно-тренажерный зал, общежитие, спортивно-оздоровительный лагерь, клинические базы в медицинских организациях Управления здравоохранения Южно-Казахстанской области.

Высококвалифицированную подготовку будущих специалистов ведет профессорско-преподавательский состав, объединяющий более 250 опытных преподавателей, в основу которого входят 28 докторов наук, 86 кандидатов наук, из них 20 профессоров и 42 доцента. ЮКГФА реализует 13 договоров о международном сотрудничестве.